Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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