Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Shisa3Q3UPR0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms