Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem253Q3UNB8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms