Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Puf60Q3UEB3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms