Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trafd1Q3UDK1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms