Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms