Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kdm4dQ3U2K5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms