Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LcorlQ3U285 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LcorlQ3U285 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms