Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Usp39Q3TIX9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Usp39Q3TIX9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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