Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms