Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hddc2Q3SXD3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Hddc2Q3SXD3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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