Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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