Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms