Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms