Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Sh3bp2Q06649 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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