Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thbs2Q03350 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms