Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Runx1Q03347 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Runx1Q03347 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms