Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec23aQ01405 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec23aQ01405 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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