Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms