Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms