Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shc1P98083 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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