Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps3aP97351 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms