Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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