Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rab3cP62823 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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