Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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