Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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