Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sh3bp1P55194 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3bp1P55194 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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