Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Abcd3P55096 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Abcd3P55096 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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