Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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