Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KdrP35918 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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KdrP35918 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KdrP35918 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KdrP35918 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KdrP35918 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms