Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms