Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprmP28828 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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