Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NapbP28663 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NapbP28663 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NapbP28663 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NapbP28663 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NapbP28663 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NapbP28663 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NapbP28663 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NapbP28663 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NapbP28663 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NapbP28663 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NapbP28663 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NapbP28663 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms