Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eif3aP23116 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms