Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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