Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TP20293 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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TP20293 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TP20293 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms