Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P20040 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P20040 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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