Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnnc1P19123 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms