Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18533 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
P18533 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
P18533 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18533 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18533 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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