Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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P18528 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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P18528 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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P18528 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18528 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18528 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18528 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18528 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18528 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18528 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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P18528 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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P18528 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18528 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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P18528 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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P18528 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
P18528 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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P18528 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18528 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18528 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
P18528 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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