Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18524 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18524 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18524 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms