Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms