Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms