Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CtsbP10605 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms