Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms