Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms