Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P04212 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P04212 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P04212 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P04212 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P04212 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P04212 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P04212 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P04212 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P04212 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P04212 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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