Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stra6O70491 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms