Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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DffaO54786 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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DffaO54786 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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DffaO54786 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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DffaO54786 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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DffaO54786 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DffaO54786 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms