Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Clk2O35491 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Clk2O35491 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Clk2O35491 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Clk2O35491 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Clk2O35491 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Clk2O35491 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Clk2O35491 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Clk2O35491 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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